Przesyłanie plików binarnych w silniku gridowym 6 x. Grid Engine 6 obsługuje bezpośrednie przesyłanie plików binarnych za pośrednictwem qsub i qrsh za pośrednictwem nowego argumentu - byn Domyślne zachowanie zakłada - bn użycie - by bezpośrednio wywołać binarny plik wykonywalny workgroupcluster. www qrsh - by usr bin uptime 7 49 up 107 dni, 35 min., 0 użytkowników, średnie obciążenie 0 12 0 03 0 01 workgroupcluster. Klient qsub 1 nie może być użyty do bezpośredniego przesyłania plików binarnych jako zadań Chociaż można było napisać mały skrypt owijania wokół plików binarnych, aby je przesłać , istnieją dwie wygodne techniki, aby przesyłać pliki binarne jako zadania bardzo prosto bez angażowania osobnego skryptu. Wpisz polecenie qsub wraz z dowolnymi flagami i opcjami, a następnie naciśnij klawisz powrotu bez podania skryptu pracy. monituj, możesz wpisać nazwę binarny Można nacisnąć powrót i kontynuować wprowadzanie kolejnych poleceń binarnych lub powłoki Po zakończeniu określania zadania naciśnij przycisk Control-D. qsub - l arch solaris64 spać 60 ctrl-D Twoje zadanie 47427 STDIN został złożony. Wpisz polecenie qsub wraz z dowolnymi flagami i opcjami, a następnie użyj konstrukcji przekierowania STDIN typu MARKER w jednej lub więcej wierszy zawierających dowolną kombinację binarnych polecenia powłoki w wierszu pomocniczym, jak powyżej Wtedy, w wierszu sam, wpisz MARKER i naciśnij return. qsub - N test EOF spać 60 EOF Twoje zadanie 47428 test został złożony. Powyższe techniki wykorzystują fakt, że qsub używa strumienia STDIN jako skryptu zadań, jeśli nie określisz pliku skryptu jako argumentu. Aby bezproblemowo zintegrować niektóre aplikacji w Twoim środowisku za pomocą klastra gridowego, może być konieczne napisanie niestandardowego skryptu do otaczania, który wykonuje pewne czynności związane z konfiguracją przed uruchomieniem zadania. Druga technika z góry może zostać osadzona w takich skryptach. Przykładowe tworzenie otoki do przesyłania binarnej partii zadanie z SunRay do farmy zaplecza W tym celu konieczne jest zmodyfikowanie zmiennej LDPRELOAD w celu usunięcia wpisu specyficznego dla SunRay. Jest ten typowy plik binarny submit owijarki qbsub można znaleźć na tym łączu Może być używany jako wersja binarna qsub Skrypt owijania umożliwia składnikowi posługiwanie się standardowymi flagami składania wniosków, a także uwzględnia flagi określone w pliku qtask, które jest używane przez qtcsh, gdy jest przezroczyste przesyłanie plików binarnych do syst em. Jest to przykład użycia tego skryptu. Jest to uruchomienie binarnego pliku netscape przy jednoczesnym zachowaniu zmiennej środowiskowej DISPLAY UWAGA oczywiście musisz upewnić się, że binarnie pasuje do architektury, na której będzie się uruchamiać. Można to określić, na przykład, robiąc to. Jak przesłać zadanie za pomocą polecenia qsub. qsub to polecenie używane do przesyłania do klastra SGE W sekcji 2 1 Krótkie wprowadzenie i podstawowe informacje pokazaliśmy, że można wysłać przykładowe zadanie, używając qsub w następujący sposób. Ogólna składnia do używania qsub jest poniżej. Jest kilka opcji i ich wyjaśnienia.-q Kolejka ustaw kolejkę Często używasz kolejki standardowej, więc nie musisz tego ustawiać. - V przejdzie wszystkie zmienne środowiskowe do zadania. - v var wartość przekazuje zmienną środowiskową var do zadania. - by polecenie allow było plikiem binarnym zamiast skryptem.-sprawdzamy opcje i zignoruj, jeśli wystąpi błąd. - N nazwa zadania nazwa zadania zobacz, kiedy używasz qstat, aby sprawdzić stan twoich prac. l hvmem size określa wielkość wymaganej pamięci, np. 3G lub 3500M UWAGA: Pamięć na slot procesora Więc jeśli zapytasz o 2 procesory, całkowita pamięć będzie wynosiła 2 hvmemvalue.-l hrt hh mm ss określa maksymalną liczbę godzin pracy, minut i sekund.-l srt hh mm ss podaj godziny pracy miękkiej godziny, minuty i sekundy - pamiętaj, aby ustawić zarówno srt jak i hrt.-pe smp nslots Określa środowisko równoległe smp uruchamia pracę równoległą przy użyciu pamięci współdzielonej i ilości nprocessors rdest.-cwd działa w bieżącym katalogu roboczym. - dod dir Ustaw katalog roboczy tego zadania jako plik dir.-o nazwa pliku wyjściowego pliku dziennika wyjściowego.-e errorlogfile nazwa pliku dziennika błędów.-m ea Wyśle wiadomość e-mail, gdy zadanie kończy się lub kończy. - P nazwa_projektu ustawia projekt zadania.-M adres e-mailadresowy adres e-mail do wysłania poczty elektronicznej do.-t początek - kończyć złożyć tablicę stanowisk z indeksem początkowego indeksu stopu w przyrostach używając. Możesz zobaczyć pełną listę argumentów i wyjaśnienia tutaj. Teraz spójrzmy na niektóre przykładowe skrypty bash i polecenia qsub które przekazują te zadania do klastra. Przesyłając zadanie bowtie. Bowtie jest krótko odczytanym wyrównywaczem używanym do wyrównywania odczytów z następnych genowych maszyn sekwencyjnych Skrypt zawiera opcje wiersza poleceń w nim, więc nie trzeba przekazywać tych opcji na linii poleceń W skrypt powłoki, można ustawić opcje qsub w wierszach zaczynających się od To alternatywa dla przekazywania ich za pomocą polecenia qsub. Ze względu na opcje, które obchodzimy są w skrypcie, nie musimy przekazywać ich poleceniem qsub Wiersze począwszy od są opcje qsub opisane powyżej Dostosowują zadanie i poprosić o zasoby, takie jak CPU i memory. The pliki wyjściowe wyjściowe dla polecenia bowtie są przechowywane w zmiennych bajtowych i outfile infile. Następnie przekazywane do polecenia bowtie To nie jest naprawdę konieczne ale łatwiej jest odczytać później, co się dzieje. Wykonanie bowtie zaczyna się od gzip - dc Ponieważ pliki fastq są kompresowane, najpierw musimy rozpakować je i podać dane wyjściowe do bowtie za pośrednictwem rury .-- chunkmbs 300 --be st - m 1 - p 6 --phred33 - q są specyficznymi funkcjami bowtie Sprawdź je w instrukcji Bowtie. Aby można to zrobić w następujący sposób, zakładając, że ten plik jest zapisywany. Jednakże przykłady przyjść. Podejmowanie plików binarnych w programie Grid Engine 6.Grid Engine 6 obsługuje bezpośrednie przesyłanie binariów za pośrednictwem qsub i qrsh za pomocą nowego argumentu - byn Domyślne zachowanie zakłada - bn użycie - by bezpośrednio wywołać binarny plik wykonywalny workgroupcluster. www qrsh - by usr bin uptime 7 49 up 107 days, 35 minut, 0 użytkowników, średnie obciążenie 0 12 0 03 0 01 workgroupcluster. Klient qsub 1 nie może być użyty do bezpośredniego przesyłania plików binarnych jako zadań Chociaż można było napisać mały skrypt owijania wokół plików binarnych, aby je przesłać, istnieją dwie wygodne techniki wysyłaj pliki binarne jako zadania bardzo prosto bez angażowania osobnego skryptu. Wpisz polecenie qsub wraz z dowolnymi flagami i opcjami, a następnie naciśnij klawisz powrotu bez podania skryptu zadań Po wyświetleniu monitu powłoki dodatkowej W tym monicie można wpisać imię binarne y Następnie można nacisnąć powrót i kontynuować wprowadzanie kolejnych poleceń binarnych lub powłoki Po zakończeniu określania zadania naciśnij przycisk Control-D. qsub - l arch solaris64 spać 60 ctrl-D Twoje zadanie 47427 STDIN został złożony. Wpisz polecenie qsub wraz z dowolnymi flagami i opcjami, a następnie użyj konstrukcji przekierowania STDIN typu MARKER w jednej lub więcej wierszy zawierających dowolną kombinację binarnych polecenia powłoki w wierszu pomocniczym, jak powyżej Wtedy, w wierszu sam, wpisz MARKER i naciśnij return. qsub - N test EOF spać 60 EOF Twoje zadanie 47428 test został złożony. Powyższe techniki wykorzystują fakt, że qsub używa strumienia STDIN jako skryptu zadań, jeśli nie określisz pliku skryptu jako argumentu. Aby bezproblemowo zintegrować niektóre aplikacji w Twoim środowisku za pomocą klastra gridowego, może być konieczne napisanie niestandardowego skryptu do otaczania, który wykonuje pewne czynności związane z konfiguracją przed uruchomieniem zadania. Druga technika z góry może zostać osadzona w takich skryptach. Przykładowe tworzenie otoki do przesyłania binarnej partii zadanie z SunRay do farmy zaplecza W tym celu konieczne jest zmodyfikowanie zmiennej LDPRELOAD w celu usunięcia wpisu specyficznego dla SunRay. Następny plik binarny submit owijarki qbsub można znaleźć na tym łączu Może być używany jako wersja binarna qsub Skrypt owijania umożliwia składnikowi posługiwanie się standardowymi flagami składania wniosków, a także uwzględnia flagi określone w pliku qtask, które jest używane przez qtcsh, gdy jest przezroczyste przesyłanie plików binarnych do syst em. Jest to przykład użycia tego skryptu. Jest to uruchomienie binarnego pliku netscape przy jednoczesnym zachowaniu zmiennej środowiskowej DISPLAY UWAGA oczywiście musisz upewnić się, że binarnie pasuje do architektury, na której będzie się uruchamiać. Można to określić, na przykład, wykonując. Aby utworzyć zadanie, należy przesłać skrypt wykonywalny do serwera wsadowego. Serwer wsadowy będzie domyślnym serwerem, chyba że podano opcję - q. Komenda analizuje skrypt przed wykonaniem skryptu, który nie wykonuje samego skryptu Wszystkie reguły pisania skryptów pozostają w mocy, w tym na początku pliku znajdziesz omówienie PBSDEFAULT w zmiennych środowiskowych Zazwyczaj skrypt to skrypt powłoki, który zostanie wykonany przez powłokę polecenia, np. Sh lub csh. Options na qsub polecenie umożliwia określenie atrybutów mających wpływ na zachowanie zadania. Komenda qsub przejdzie przez określone zmienne środowiskowe w atrybucie ZmiennaList zadania. Te zmienne będą dostępne lable to the job Wartość dla następujących zmiennych zostanie pobrana z środowiska polecenia qsub HOME, LANG, LOGNAME, ŚCIEŻKA, MAIL, SHELL i TZ Te wartości zostaną przyporządkowane do nowej nazwy, która jest aktualną nazwą z prefiksem ciąg PBSO Na przykład zadanie będzie miało dostęp do zmiennej środowiskowej o nazwie PBSOHOME, która ma wartość zmiennej HOME w środowisku polecenia qsub. Oprócz powyższego, dla zadania wsadowego będą dostępne następujące zmienne środowiskowe. nazwa hosta, na którym jest uruchomiona komenda qsub. Nazwa hosta serwera pbsserver, który qsub przekazuje zadanie. Nazwa oryginalnej kolejki, do której została złożona zadanie. Absolutna ścieżka do bieżącego katalogu roboczego polecenia qsub. Każdy członek tablicy zadań jest przypisany unikatowy identyfikator w sekcji - t option. Set do PBSBATCH, aby wskazać, że zadanie jest zadaniem wsadowym, lub PBSINTERACTIVE, aby wskazać, że zadanie jest interaktywnym zadaniem PBS, zobacz - I. Nazwa pliku zawierający th e lista przypisanych GPU. Identyfikator zadania przypisany do zadania przez system wsadowy Może być używany w ścieżkach stdout i stderr TORQUE zastępuje PBSJOBID z jobid s jobid np. PBS - o. Nazwa zadania dostarczona przez użytkownika. Nazwa pliku zawiera listę węzłów przypisanych do zadania dla systemów równoległych i klastrowych. Określa czas, po upływie którego zadanie może zostać wykonane. Argument datetime jest w formie. Gdzie CC to pierwsze dwie cyfry roku YY jest drugą liczbą cyfr w roku, MM oznacza dwie cyfry miesiąca, DD oznacza dzień miesiąca, hh jest godziną, mm jest minutą, a opcjonalne SS to sekundy. miesiąc MM nie jest określony, domyślnie do bieżącego miesiąca, jeśli podany dzień DD ma być w przyszłości Jeśli nie, miesiąc zostanie ustawiony na następny miesiąc Podobnie, jeśli nie zostanie podany dzień DD, domyślnie będzie on wynosić, jeśli czas hhmm jest w przyszłości Jeśli nie, dzień zostanie ustawiony na jutrzejsze. Na przykład, jeśli złożysz zadanie a t 11 15 rano o godzinie 1110 praca będzie mogła rozpocząć się o 11 10. jutro. Definiuje ciąg konta związany z zadaniem Accountstring jest nieokreślonym ciągiem znaków i jest interpretowany przez serwer, który wykonuje zadanie Patrz sekcja 2 7 1 PBS ERS. Określa maksymalną liczbę sekund qsub zablokuje próbę nawiązania połączenia z serwerem pbsserver Jeśli serwer pbsserver jest wyłączony lub w przypadku wielu usterek komunikacyjnych, qsub będzie kontynuował ponowne próbowanie połączenia z serwerem pbsserver w celu składania zadań. Ta wartość zastępuje parametr CLIENTRETRY w To nie przenośne rozszerzenie TORQUE Użytkownicy przemyślalni mogą korzystać z zmiennej środowiskowej PBSCLIENTRETRY Ujemna wartość jest interpretowana jako nieskończoność Domyślna wartość to 0. Określa opcje, które mają zastosowanie do zadania Jeśli zadanie wykonywane jest przez hosta który nie obsługuje punktu kontrolnego, opcje te zostaną zignorowane. Właściwymi opcjami punktu kontrolnego są. none Nie ma potrzeby wykonywania checkpointing. enabled Określ, że checkpointing jest dozwolony, ale mus t jawnie wywoływana przez komendy qhold lub qchkpt commands. shutdown Należy określić, że punkt kontrolny ma być wykonany w zadaniu w punkcie pbsmom shutdown. periodic Określa, że jest włączone okresowe sprawdzanie punktowe Domyślny przedział wynosi 10 minut i może być zmieniony przez opcję checkpointinterval w Pliku konfiguracyjnego MOM lub określając przedział czasowy, w którym zostało złożone zadanie. interval minutes Zdefiniuj punkt kontrolny w odstępie minutowym, czyli całkowitą liczbę minut ścian używanych przez zadanie Wartość ta musi być większa niż zero. depth liczba Określ liczbę głębi punktów kontrolnych, które mają być przechowywane w punkcie kontrolnym ścieżka katalogu. dir Określenie domyślnego katalogu punktu kontrolnego to punkt kontrolny momentu obrotowego var. Określa przedrostek, który deklaruje dyrektywę do polecenia qsub w pliku skryptu Zobacz akapit w dyrektywach skryptowych w rozszerzonym opisie. Jeśli opcja - C zostanie zaprezentowana przez argument directiveprefix, który jest łańcuchem pustym, qsub nie będzie skanował pliku skryptu for directives. Defines ścieżki katalogu roboczego, który ma być używany do zadania Jeśli opcja - d nie jest określona, domyślnym katalogiem roboczym jest katalog domowy Opcja ta ustawia zmienną środowiskową PBSOINITDIR. Definiuje katalog główny, który ma być używany dla zadania opcja ustawia zmienną środowiskową PBSOROOTDIR. Określa ścieżkę, która ma być używana dla standardowego strumienia błędów zadania wsadowego Argument ścieżki to nazwa hosta form. where to nazwa hosta, do którego zostanie zwrócony plik, a nazwa ścieżki to nazwa ścieżki na tym hoście w składni rozpoznawanej przez POSIX Argument zostanie zinterpretowany następująco: ścieżka dostępu, gdzie ścieżka nie jest nazwą bezwzględnej ścieżki, wówczas polecenie qsub rozszerzy nazwę ścieżki w stosunku do bieżącego katalogu roboczego komendy Polecenie będzie podaj nazwę hosta, na którym jest wykonywana nazwa hosta nazwa_hosta nazwa_pliku, gdzie ścieżka nie jest nazwą ścieżki bezwzględnej, a następnie polecenie qsub nie rozwinie nazwy ścieżki relat ive do bieżącego katalogu roboczego polecenia Podczas dostarczania standardowego błędu nazwa ścieżki zostanie rozszerzona w stosunku do katalogu domowego użytkownika w nazwie system. pathname, gdzie ścieżka określa bezwzględną nazwę ścieżki, a następnie qsub poda nazwę host, na którym wykonuje się nazwę hostname. hostname, gdzie ścieżka określa nazwę bezwzględnej ścieżki, ścieżka zostanie użyta jako określona. Jeśli nie zostanie podana opcja - e, zostanie użyta domyślna nazwa pliku dla standardowego strumienia błędów Domyślna nazwa ma następującą postać. gdzie nazwa pracy jest nazwą zadania, zobacz opcję - n nazwa i numer sekwencyjny to numer zadania przypisany do zlecenia. Job jest odporny na błędy Praca z wieloma węzłami jest okresowo badana przez matkę wyższą Jeśli jeden z węzłów nie powiedzie się raport, zadanie zostaje anulowane przez nadrzędnego przełożonego i zgłoszona jest awaria Jeśli praca jest odporna na błędy, nie zostanie ona anulowana w oparciu o nieudane odpytywanie niezależnie od tego, ile węzłów nie zgłosić Może to być pożądane, jeśli przejściowe awarie sieci powodują duże zadania nie do zakończenia, gdzie ignorowanie jednej nieudanej próby odpytywania można skorygować przy następnej próbie odpytywania. Jeśli TORQUE jest kompilowany z PBSNOPOSIXVIOLATION, nie ma takiej opcji konfiguracyjnej, musisz użyć parametru - W faulttolerant true, aby zaznaczyć zadanie jako tolerancyjny. argumenty, które zostaną przekazane do skryptu pracy podczas uruchamiania skryptu Przyjęta składnia is. qsub - F myarg1 myarg2 myarg3 myarg3value. Znaczniki zapytania są wymagane qsub nie powiedzie się z błędem mes sage jeśli argument następujący - F nie jest wartością podaną przez serwer Serwer pbsmom przekazuje cytowaną wartość jako argumenty do skryptu zadania podczas uruchamiania skryptu. Opcja - W umożliwia określenie dodatkowych atrybutów zadań Ogólna składnia - W jest w formie. Jeśli biała przestrzeń ma miejsce w dowolnym miejscu wewnątrz łańcucha argumentu opcji lub znaku równości, występuje w ciągu atrybutu attributevalue, to ciąg musi być zamknięty pojedynczymi lub podwójnymi znakami cytatu. PBS obecnie obsługuje następujące atrybuty w sekcji - W opcjonalna zależność Określa zależność między tym a innymi zadaniami Lista zależności jest w formie. Argumentem jest albo liczba liczbowa lub identyfikator zadania PBS według typu Jeśli argument jest licznikiem, musi być większy niż 0 Jeśli jest to identyfikator zadania i nie jest w pełni określony w formularzu, który zostanie rozszerzony zgodnie z domyślnymi regułami serwera, które mają zastosowanie do identyfikatorów zadań większości komend Jeśli argument jest zerowy, poprzedzający dwukropek nie musi być określony, cyfry odpowiadającego typu są usuwane niezaznaczone Aby uzyskać więcej informacji, zobacz zależność dependencylist dependencylist valid dependencies. grouplist glist Określa nazwę grupy, pod którą ma być wykonywane zadanie w systemie wykonawczym Argument glist ma postać. Tylko jedna grupa może być podana na określony host Jedynie jedna z specyfikacji grupy może być dostarczona bez odpowiedniej specyfikacji hosta Ta nazwa grupy będzie używana do wykonania na dowolnym hostie, który nie został wymieniony na liście argumentów Jeśli nie ustawiono, grupa domyślnie ustawiona jest na podstawową grupę użytkownika, pod zadanie będzie uruchamiane. interaktywne Jeśli podano atrybut interaktywny, zadanie jest zadaniem interaktywnym Opcja - I to alternatywna metoda określania tego atrybutu. jobradix int Do użycia z zadaniami równoległymi Kieruje przełożoną matki na zadanie utworzyć dystrybucję radix o rozmiarze int między siostrami Zobacz Zarządzanie multi-node jobs. stageout filelist Określa, które pliki są kopiowane przed rozpoczęciem pracy lub wystawieniem fter zadanie zakończy wykonanie Po zakończeniu zadania wszystkie pliki staged-in i stage-out są usuwane z systemu wykonywania Filelista jest w formie. niezależnie od kierunku kopiowania Nazwa localfile jest nazwą pliku na system, w którym wykonywane zadanie Może to być ścieżka bezwzględna lub względna do katalogu domowego użytkownika Nazwa remotefile to nazwa docelowa na hoście określonym przez nazwę hosta Nazwa może być bezwzględna lub względna dla katalogu domowego użytkownika na docelowym komputerze Użycie symboli wieloznacznych w nazwie pliku nie jest zalecane Nazwa pliku mapuje do zdalnego programu kopiującego wywołanie rcp w systemie wykonywania w następujący sposób. For stagein rcp nazwa_użytkownika nazwa_użytkownika localfile. For stageout rcp nazwa_lokalna nazwa_użytkownika nazwa_użytkownika. TORQUE został skompilowany z obsługą wordexp, a zmienne mogą być użyte w określonych ścieżkach Obecnie tylko PBSJOBID HOME i TMPDIR są obsługiwane dla stagein. umask XXX Ustawia umask używany do tworzenia stdout i pliki buforu stderr w katalogu buforu pbsmom Wartości zaczynające się od 0 traktowane są jako wartości ósemkowe, w przeciwnym wypadku wartość jest traktowana jako wartość dziesiętna umask. Na domyślne, jeśli złożysz interaktywne zadanie ze skryptem, skrypt zostanie przeanalizowany pod kątem dyrektyw PBS ale reszta skryptu zostanie zignorowana, ponieważ jest to zadanie interaktywne Opcja - x pozwala na wykonanie skryptu w zadaniu interaktywnym, a następnie wykonaniu zadania Na przykład. bin bash ls --- skrypt końcowy --- qsub - I qsub czekanie na zadanie, aby rozpocząć zabezpieczenie poczty elektronicznej wyświetla zawartość katalogu, ponieważ wykonano zadanie ls qsub job. Enables przekazanie X11 Zmienna środowiskowa DISPLAY musi być ustawiona. When to zadanie kończy wykonanie, można rozpocząć zadania w tablicy. Jeśli użyto dowolnej z poprzednich formularzy, zadania, do których odwołuje się arrayid, muszą zostać przesłane z typem zależności. Jeśli jest używany dowolny z poprzednich formularzy, zadanie odwołane przez arrayid musi mieć tego samego właściciela, co zadanie, które zostało złożone. W przeciwnym razie zależność jest ignorowana. Przerwa w przetwarzaniu istnienia, stanu lub kondycji pracy, na której nowo nadsyłane zadanie jest usługą odroczoną, tzn. sprawdzenie jest wykonywane po wykonaniu zadania w kolejce Jeśli wykryty zostanie błąd, nowe zadanie zostanie usunięte przez serwer. Mail zostanie wysłany do zleceniodawcy z podaniem błędu. qsub - W tmp skrypt. qsub - W zależność 421. Zakłada się, że każde zadanie w tablicy 427 musi zakończyć pomyślnie dla depe ndency to satisfied. qsub - W depends afterokarray 427 5. Oznacza to, że 5 zleceń w tablicy 427 musi zakończyć się pomyślnie, aby zależność była satysfakcjonująca. Komenda qsub akceptuje operand skryptu będący ścieżką do skryptu zadania Jeśli ścieżka jest względna, zostanie rozszerzona w stosunku do katalogu roboczego komendy qsub. Jeśli argument skryptu nie zostanie podany lub operand jest pojedynczym znakiem - komenda qsub odczytuje skrypt ze standardowego wejścia skrypt jest czytany ze standardowego wejścia, qsub skopiuje plik do pliku tymczasowego Ten tymczasowy plik jest przekazywany do interfejsu biblioteki pbssubmit Plik tymczasowy jest usuwany przez qsub po zwrocie pbssubmit lub po otrzymaniu sygnału, który spowodowałby qsub kończy się. Komenda qsub odczytuje skrypt dla zadania ze standardowego wejścia, jeśli brakuje operandu skryptu lub jest pojedynczym znakiem. Plik skryptowy jest odczytywany przez polecenie qsub qsub działa na wszelkie dyrektywy znalezione w e skrypt. W przypadku utworzenia zadania kopia pliku skryptu jest wykonywana i kopia nie może być modyfikowana. Jeśli nie ustawiono opcji - z, identyfikator zadania przypisany do zadania zostanie zapisany na standardowe wyjście, jeśli zadanie zostanie pomyślnie created. Komenda qsub zapisze komunikat diagnostyczny do błędu standardowego dla każdego wystąpienia błędu. Wartości niektórych lub wszystkich zmiennych w środowisku poleceń qsub są eksportowane z zadaniem z opcjami - v i - v. Zmienna środowiskowa PBSDEFAULT definiuje nazwę serwera domyślnego Zazwyczaj odpowiada nazwie systemu hosta, na którym działa serwer Jeśli PBSDEFAULT nie jest ustawiony, domyślnie jest on definiowany przez plik utworzony przez administratora. Zmienna środowiskowa PBSDPREFIX określa ciąg prefiksu, który identyfikuje w zmiennej środowiskowej PBSCLIENTRETRY definiuje maksymalną liczbę sekund qsub zablokuje opcję - b Mimo nazwy, obecnie qsub jest jedynym klientem obsługującym to ption Plik, zlokalizowany domyślnie w torze PBSSERVERHOME var buduje kontrolę zachowania polecenia qsub Ten plik zawiera listę parametrów i wartości oddzielonych białymi spacjami. QSUBSLEEP przyjmuje argument typu integer, który określa czas, w którym spać podczas uruchamiania polecenia qsub Używany do zapobiegania użytkowników z przytłaczającego harmonogramu. SUBMITFILTER określa ścieżkę do filtru wysyłania używanego do wstępnego przetworzenia składania zadań Domyślną ścieżką jest lsubfilter libexecdir, który sprowadza się do usr local sbin torqueubmitfilter w celu zapewnienia wstecznej kompatybilności Ten parametr nadpisuje to domyślne. Skrypt zadania może składać się dyrektyw PBS, komentarzy i instrukcji wykonywalnych Dyrektywa PBS umożliwia określenie atrybutów pracy oprócz opcji wiersza komend Przykładowo. PBS - l walltime 10 30, mem 320kb. step1 arg1 arg2.step2 arg3 arg4. Komenda qsub skanuje linie pliku skryptowego dla dyrektyw Linia początkowa w skrypcie, która rozpoczyna się od znaków lub znaku, zostanie zignorowana, a skanowanie będzie zaczynaj od następnej linii Skanowanie będzie kontynuowane do pierwszej linii wykonywalnej, tj. linii, która nie jest pusta, a nie linii dyrektywy, ani linii, której pierwszy nie biały znak przestrzenny jest Jeśli dyrektywy pojawiają się w kolejnych wierszach, zostaną one zignorowane. Linia w pliku skryptu zostanie przetworzona jako dyrektywa do qsub jeśli i tylko wtedy, gdy ciąg znaków zaczynający się od pierwszego nie białego znaku spacji na linii i tej samej długości, co przedrostek dyrektywy odpowiada prefiksowi dyrektywy. Pozostała część linia dyrektywy składa się z opcji qsub o tej samej składni, która pojawia się w wierszu poleceń Znak opcji powinien być poprzedzony znakiem --.Jeżeli opcja jest obecna zarówno w dyrektywie, jak iw linii poleceń, to opti on i jego argument, jeśli w ogóle, zostaną zignorowane w dyrektywie Wiersz poleceń ma pierwszeństwo. Jeśli opcja jest obecna w dyrektywie, a nie w wierszu komend, opcja i jej argument, jeśli są, zostaną przetworzone tak, wystąpił na linii poleceń. Prefiks dyrektywy będzie określany w kolejności od preferencji. Wartość argumentu - c opcji, jeśli opcja jest określona w wierszu polecenia. Wartość zmiennej środowiskowej PBSDPREFIX, jeśli została zdefiniowana. Czterech znaków łańcucha PBS. Jeśli opcja - c znajduje się w dyrektywie w pliku skryptu, zostanie ona zignorowana. Gdy użytkownik składa pracę z innego systemu niż ten, na którym działa serwer PBS, nazwa pod które zadanie ma być wykonywane jest wybierane zgodnie z regułami podanymi w opcji - u Użytkownik, który złożył zadanie musi być upoważniony do uruchomienia zadania pod nazwą użytkownika Wykonanie Niniejsza autoryzacja jest udostępniana, jeśli host, na którym jest uruchomiony qsub zaufany przez hosta wykonawczego użytkownik powłoki ma plik nazywający użytkownika w pliku zgłoszeniowym host. C-Shell. Następujące ostrzeżenie dotyczy użytkowników systemu c-shell, csh Jeśli zadanie jest wykonywane pod csh i plik istnieje w katalogu domowym, w którym zadanie jest wykonywane, stan wyjścia zadania to skrypt, a nie skrypt zadania Może to wpływać na zależność między zadaniami Aby zachować status wyjścia z pracy, usuń plik lub umieść następującą linię jako pierwsza linia w plik. set EXITVAL status. and następującą linię jako ostatnia linia wykonywalna w pliku. If podano opcję - I w wierszu komend lub w dyrektywie skryptu lub jeśli interakcyjny atrybut job zadeklarował true za pomocą opcji - W, - W interaktywna prawda w wierszu polecenia lub w instrukcji skryptu, zadanie jest zadaniem interaktywnym Skrypt zostanie przetworzony dla dyrektyw, ale nie zostanie dołączony do zadania Kiedy zadanie rozpocznie wykonywanie, wszystkie dane wejściowe do zadania są z terminala sesji, w której qsub jest uruchomiony. Kiedy int zostanie wysłane zadanie qsub, polecenie qsub nie zostanie zakończone, gdy zadanie zostanie wysłane qsub będzie działało, dopóki zadanie nie zostanie zakończone, zostanie przerwane lub użytkownik przerywa qsub za pomocą przycisku SIGINT klucz kontrolny-C Jeśli qsub zostanie przerwany przed rozpoczęciem zadania, będzie zapytać, czy użytkownik chce wyjść Jeśli odpowiedź użytkownika tak, qsub opuszcza i zadanie zostanie przerwane. One rozpoczęło się zadanie interaktywne, wprowadzanie i wychodzenie z przejścia z pracy poprzez qsub wygenerowane przez użytkownika wygenerowane przerwania są przekazywane do linii zadań wprowadzone, które zaczynają się od tyldy. znak i zawierają specjalne sekwencje są uciekane przez qsub Uznane sekwencje ewakuacji są. Qub nadają binarne opcje. Open MP używa gwintowanej pamięci współdzielonej wszystkie procesory dzielą przestrzeń adresową Qsub wysyłają opcje binarne Jest to opakowanie dla mpirun i zajmuje się przekazaniem numeru procesorów i pliku o nazwie Machine Online Trading Nz Opcje Qsub scriptfile Jest obowiązkowe użycie skryptu, ponieważ nie można podać plików binarnych bezpośrednio do Torque PBS Podstawową strukturę skryptu jest wyświetlana 4 lutego 2017 Po utworzeniu skryptu, prześlij go do harmonogramu z qsub Uruchom program zastępuje echo z indeksem binarnym i opcje echo Rozpoczęcie pracy na giełdzie 21 grudnia 2017 TORQUE w IU TORQUE przegląd Skrypty zadań Przesyłanie zadań Monitorowanie w skrypcie zadań wsadowych lub jako opcji wiersza polecenia dla polecenie qsub, aby wykonać polecenie. bin binaryname binary na 12 procesorach z programów MPI nie używaj modelu pamięci współdzielonej, dzięki czemu mogą być uruchamiane w wielu węzłach Po utworzeniu skryptu, prześlij go do harmonogramu za pomocą tych skryptów dotyczy to również Grace, ale pamiętaj, że zazwyczaj powinieneś dostarczanie wielu MPI MPI lub hybrydowych MPI Otwieranie zadań MP tam mniejsze miejsca pracy powinny być uruchamiane tylko do celów testowych Wszyscy są teraz częścią projektu All Users domyślnie Qsub przedstawiają opcje binarne System zysków z zysku w systemie Starsze przykłady scenariuszy pracy wspomnieć o identyfikatorze projektu - można usunąć tę linię Qsub złożyć opcje binarne W systemie Legion zadania te mogą używać do dwunastu procesorów na węzłach typu X, Y i Z, maksymalnych dostępnych na jednym węźle tych typów Qsub - przesłać zlecenie wsadowe do Sun Grid Silnik qsh - przesyłanie interaktywnego polecenia może stanowić ścieżkę do pliku binarnego lub skryptu, o którym mowa w sekcji - b poniżej, zawierającej Forces qsub, qrsh, qsh lub qlogin, aby używać opcji zawartych w pliku optionfile Domyślne implementacje MPI n na naszych klastrach jest stos Intel MPI. Kubuj opcje binarne Kalkulator walutowy Forex. Najważniejszym rodzajem pracy, którą użytkownik może zgłosić do klastra Legion, jest praca seryjna Poniżej przedstawiono prosty skrypt pracy, który uruchamia datę bin, która drukuje bieżąca data na węzłach obliczeniowych w Legionie Qsub przedstawia opcje binarne Uwcfx Forex Trading 21 grudnia 2017 TORQUE w przeglądarce IU TORQUE Skrypty zadań Wysyłanie zadań Monitorowanie w skrypcie zadań wsadowych lub jako opcji wiersza polecenia do polecenia polecenia qsub w celu wykonania polecenia. bin binaryname binary na 12 procesorach z pierwszego typu równoległego zadania, które można uruchomić to zadanie Open MP Pełny opis polityki zarządzania danymi znajdziesz w sekcji zarządzania danymi w Podręczniku użytkownika Projekty z dostępem do płatnych lub specjalistycznych zasobów powinny nadal używać ich nazwy projektu przy wykorzystaniu tych zasobów - dodaj to do skryptów pracy Użytkownicy, którzy zarejestrowali się lub zarejestrowali ponownie po 23 lipca 2017 r., nie muszą wypełniać nazwy projektu Przekazując argumenty skryptowi powłoki przesłanym przez qsub W skrypcie powłoki, możesz ustawić te opcje w wierszach zaczynających się od nich lub przekazywać je wraz z poleceniem qsub - przez --- allow polecenie jako plik binarny zamiast skryptu Qsub przedstawia opcje binarne Xilinx Netgen Opcje Trading Opcje skryptowe Qsub Jest to obowiązkowe w użyciu plik skryptowy, ponieważ nie można przesyłać plików binarnych bezpośrednio do Torque PBS Wyświetlana jest podstawowa struktura skryptu Załóżmy, że skompilowano binarne MPI o nazwie mpitest, patrz sekcja 8 2 dla Th e SGE qsub option - masterq ehtpx-cluster q w skrypcie pracy odnosi się do tego skryptu znacznie różni się od prac seryjnych i Open MP w tym programach MPI, które muszą być wywoływane przez program o nazwie gerun 21 grudnia 2017 TORQUE w IU TORQUE overview Skrypty zadań Przesyłanie zadań Monitorowanie w skrypcie zadań wsadowych lub jako opcji wiersza polecenia do polecenia polecenia qsub w celu wykonania polecenia. bin binarny binarny na 12 procesorach z tych zadań pracuje na jednym procesorze z pojedynczym wątkiem. Open High Low Zamknij Forex Data Historia Binarny Broker opcji z Builder Strategies 21 Jak można zarabiać pieniądze online W Vanuatu. Top Binary Options Brokers W porównaniu z tak wielu online binarnych opcji handlu maklerów wszystkie walczą o pokonanie konkurencji dla Twojej firmy zauważysz, że to Położony w samym sercu wsi Philippi jest Cheval Vapeur, ciche sanktuarium dedykowane Duchowi koni Stocznia jest przyjazny i zrelaksowany i naszym celem jest Kolekcja Forex - strategie handlowe Mega Package Pakiet Forex - Trading Mega Package Bardzo duże archiwum Pakiet oprogramowania Forex EA roboty 2000, wskaźniki Na tej stronie opisujemy kilka podstawowych skryptów przykładowych do składania zadań do Legion lub Grace Qsub do składania opcji binarnych Ważne Jeśli chcesz pass a file to the stdin of an MPI program, you need to use the - stdin filename option for some input file called filename rather than using redi rections are equivalent and will both Tai Padaryti Akcij Prekybos Lietuvoje The primary differences between this job script and the serial job script are in 6 The OMPNUMTHREADS variable is set automatically to the number of threads Forex Congratulations Happy New Year Lyrics If you use Open MPI, you need to make sure the Intel mpi modules are removed and the Open MPI modules are loaded, either in your or else in the script itself. Learning Resources. Menu When you re on-the-move, use HotForex MT4 Mobile to access your Trading Account and trade through your Android mobile phone and tablet Our HotForex HOTFOREX ANDROID Trade on-the-go on via your Android phone and tablet with HotForex MT4 Android Read more SMARTPHONE FOREX TRADING MetaTrader is the most popular front-end application in the industry and it is available to all our Mac OS users, ready to download directly to your computer in just. Forex Club It Dts Or Broker Trading Platform For Nyse. Forex Club, established in 1997, is the bra nd name for a group of companies that provides clients from over 120 countries with platforms and services for trading Learn about Forex Club broker reviews and submit your own review broker reviews HOME SEARCH Tags Forex Club reviews Andrea May 3, 2017.
No comments:
Post a Comment